Per convertire i filmati in una forma compatta, dopo vari tentativi sono arrivato a scegliere questa soluzione:

1) prima si concatenano gli spezzoni della telecamera

cat /media/disk/MP_ROOT/101PNV01/M2U0018{1,2,3,4}.MPG > sex.mpg

2) quindi si convertono a flash con mencoder

mencoder -forceidx -of lavf -oac mp3lame -lameopts abr:br=56 -srate 22050 -ovc lavc -lavcopts vcodec=flv:vbitrate=250:mbd=2:mv0:trell:v4mv:cbp:last_pred=3 -vf scale=720:480 -o sex.flv sex.mpg

da un filmato originale di 4.5GB sono arrivato ad un video di 250 MB in qualità decente. Resta da vedere se funziona per windows.